堯、舜、夏、商、周時代，高唐屬兗州之域。春秋時為齊國西界，戰(zhàn)國時為齊之西邑，境接趙、衛(wèi)。

公元前221年，秦分天下為三十六郡，高唐屬東郡。

公元前206年，漢新置高唐縣，屬青州部平原郡。

220年魏朝建立，設十二州七十五國、郡，高唐屬青州部清河郡。

265年（晉武帝泰始元年）高唐屬新置之冀州部平原國。

317年以后，為避戰(zhàn)亂，晉室官吏及部分地方百姓南渡，至今安徽省境江淮間，建立起僑居高唐縣制，隸屬僑置之南平原郡，原境高唐縣廢。現(xiàn)安徽省霍邱縣西30公里處尚有名曰高唐集的村鎮(zhèn)，即當時僑置高唐縣之所在。

420年后，南北朝時，劉宋疆域北擴，占據(jù)了山東中部和東部，原高唐縣境仍被北魏所據(jù)。432年（文帝元嘉九年），僑置高唐縣由安徽省遷至山東省梁鄒長山（即今鄒平縣東長山的高唐莊），屬僑置冀州東平原郡。

469年（北魏皇興三年）冀州更名齊州，高唐縣屬齊州僑東平原郡。556年（北齊天保七年）遷僑縣治所于黃巾堌，即今濟南市章丘區(qū)水寨，仍屬東平原郡，到596年（隋開皇十六年）改僑高唐縣為章丘縣。

502年（北魏景明三年）原址復置高唐縣（與僑置縣制并存），屬始建濟州南清河郡。

556年（北齊天保七年），廢南清河郡，高唐縣城遷至廢郡城（即今現(xiàn)城址）。高唐縣改屬濟州部清河郡。

581年（隋開皇元年），高唐屬冀州部清河郡。596年（隋開皇十六年）置博州，高唐改屬博州。607年（隋大業(yè)三年），又改屬冀州部清河郡。

627年（唐太宗貞觀元年），分全國為十道，高唐屬河北道博州博平郡。唐末屬魏博節(jié)度使。

907年，五代十國開始，梁、唐、晉、漢、周相繼統(tǒng)治中國北方，高唐縣俱屬河北道博州。

960年（宋太祖建隆元年），分全國為十五道，高唐屬河北道博州。994年（宋淳化五年）改道為路，高唐縣屬河北東路博州。1078年（宋神宗元豐元年）析為23路，高唐縣屬河北東路博州博平郡。 

1128年后黃河以北俱被金軍占領，高唐為金所轄。金承宋制，在北方分19路，高唐縣屬山東西路博州博平郡。

元朝在全國設1個中書省和11個行省，行省下設路、府、州、縣。高唐初屬大名路，后屬東平路。1266年（至元三年）改博州為東昌，高唐屬東昌路。1270年（至元七年）于高唐縣置高唐州，領三縣：恩縣、夏津、武城。高唐州直屬中書省。

明朝改行省為布政司，廢路存府、州。1368年（明太祖洪武元年），高唐設置為州，統(tǒng)三縣：恩縣、夏津、武城。高唐州直屬山東布政司。后改屬東昌府，不領縣。

清初全國設18個行省（光緒年間增至23個行省），省下設府（直隸州）、縣（州）兩級。高唐州屬東昌府。1730年（雍正八年），高唐州升為直隸州，割濟南府之禹城、平原、臨邑、陵縣4縣屬之。1734年（雍正十二年）仍改隸東昌府，所領各縣回歸濟南府。

1912年（民國元年）改高唐州為縣，屬山東東臨道。1928年（民國17年）廢道直隸山東省府。抗日戰(zhàn)爭時期，共產黨縣機關，屬中共魯西北特委。1945年縣城解放，高唐隸屬中國共產黨領導的冀南行署第二專署。中華人民共和國成立后，高唐改屬平原省聊城專區(qū)專員公署。

1950年將茌平縣侯橋等11個村莊劃歸高唐縣。

1952年撤平原省，高唐隨聊城專署改屬山東省聊城專區(qū)專員公署。

1956年3月撤銷清平縣后，將其舊城鎮(zhèn)劃入高唐縣；同時將茌平縣琉璃寺鄉(xiāng)劃歸高唐縣。

1958年12月，國務院批準撤銷禹城縣全境并入高唐，

1961年10月恢復禹城縣，高唐縣仍轄原境。

1967年聊城專區(qū)改稱地區(qū)，高唐縣屬山東省聊城地區(qū)行政公署。

1998年，聊城地區(qū)改為聊城市，高唐縣屬山東省聊城市至今。